科學(xué)家已經(jīng)確定了可以作為慢性炎性疾病的潛在治療方法的兩種小分子靶點。根據(jù)PLOS計算生物學(xué)雜志發(fā)表的論文,研究人員使用他們開發(fā)的新的藥物篩選方法分析了這兩個分子。
稱為T23和T8的兩種分子抑制被叫作腫瘤壞死因子(TNF)的蛋白質(zhì)的功能,其參與諸如類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎,克羅恩病,牛皮癬,多發(fā)性硬化等疾病的炎癥過程。抑制TNF功能的藥物被認(rèn)為是最有效的對抗這些疾病的方法。然而,并不是所有的患者都對這些藥物做出了反應(yīng),并且隨著時間的推移,它們的功效可能會消失。
為了幫助發(fā)現(xiàn)更好的TNF抑制藥物,Georgia Melagraki和來自希臘和塞浦路斯的同事開發(fā)了一種新的基于計算機(jī)的藥物篩選平臺。該平臺包含TNF和另一種稱為RANKL的蛋白質(zhì)之間共同的專有分子性質(zhì),RANKL也參與慢性炎性疾病。
研究人員開發(fā)了基于先進(jìn)計算工具的平臺。然后使用該平臺來實際篩選近15,000個具有未知活性的小分子,并預(yù)測它們與TNF和RANKL蛋白的相互作用; 具體來說,就是小分子可能如何破壞導(dǎo)致這些關(guān)鍵蛋白質(zhì)的三聚和活化的蛋白質(zhì)相互作用(PPI)。 “這個虛擬實驗從成千上萬的候選者中發(fā)現(xiàn)了九種有希望的分子,”研究共同作者NovaMechanics有限公司的Antreas Afantitis說道。
為了進(jìn)一步評估其潛力,科學(xué)家們研究了9個小分子與實際實驗中的TNF和RANKL的相互作用。在9個分子中,T23和T8表現(xiàn)為特別強的TNF抑制作用。兩個分子都與TNF和RANKL結(jié)合,阻止它們與其他蛋白質(zhì)正確發(fā)生相互作用。兩者在人體中也可能引起毒副作用。
亞歷山大·弗萊明(Alexander Fleming)生物醫(yī)學(xué)科學(xué)研究中心的研究人員,即研究共同作者George Kollias說:“T23和T8可以進(jìn)一步優(yōu)化,以開發(fā)一系列炎癥,自身免疫和骨丟失疾病的治療方法”。同時,新的虛擬藥物篩選方法可以發(fā)現(xiàn)其他有希望的TNF抑制劑,并且可以進(jìn)行修改以尋找治療其他疾病的潛在方法。(生物谷Bioon.com)