目的 圓環(huán)病毒 2 型(porcine circovirus type 2,PCV2)能否感染人類細胞一直都是一個爭論的話題。 本研究通過轉(zhuǎn)錄組測序(RNA sequencing,RNA-seq)技術(shù)分析 PCV2 感染人源細胞后的差異表達基因及其相關(guān)的信 號通路、生物學功能,以期為人源細胞對 PCV2 及其他病毒產(chǎn)生抗病毒效應(yīng)的研究提供參考。
方法 用 PCV2 感染 HeLa 細胞,然后進行 RNA-seq 技術(shù)分析,篩選與抗病毒反應(yīng)相關(guān)的差異表達基因( differentially expressed genes, DEGs),并通過實時定量 PCR 進一步驗證。
結(jié)果 在感染 PCV2 的 HeLa 細胞中共注釋到 15402 個 UniGenes,其中有 387 個 DEGs(包括 267 個上調(diào)基因和 120 個下調(diào)基因)。 對生物過程類 DEGs 進行 GO 富集和 KEGG 通路分析, 發(fā)現(xiàn)富集基因要參與應(yīng)激反應(yīng)(97 / 291 DEGs) 和免疫系統(tǒng)過程(80 / 291 DEGs),其中最顯著兩條途徑的基因是 NOD 樣受體信號途徑(21 / 170 DEGs)和單純皰疹病毒感染途徑(22 / 170 DEGs)相關(guān)差異表達基因。
結(jié)論 PCV2 感染 HeLa 細胞之后,改變了細胞的表達譜,獲得的 DEGs 及其功能注釋信息有助于理解其抗病毒機制,對于了解 PCV2 感染人源細胞所產(chǎn)生的免疫反應(yīng)及抗病毒效力提供依據(jù)。