目的: 建立小鼠冷凍胚胎和精子SNP (single nucleotide polymorphism)分型方法,用于冷凍胚胎和精子快速遺傳鑒定方案。
方法: 以中科院上海實(shí)驗(yàn)動物中心(國家嚙齒類實(shí)驗(yàn)動物種子中心上海分中心)提供的小鼠冷凍胚胎和精子為樣本,采用全基因組擴(kuò)增技術(shù)和PCR-LDR分型技術(shù)建立小鼠冷凍物SNP遺傳鑒定方法。
結(jié)果: 全基因組擴(kuò)增技術(shù)能大幅度增加冷凍胚胎樣本的DNA總量;PCR-LDR分型方法適用于小鼠全基因組45個SNPs的分型;分型確定C57BL/6, BALB/c, FVB/NJ等胚胎和精子各10種近交系,SNP位點(diǎn)信息與測序結(jié)果一致;小鼠冷凍胚胎個數(shù)與SNPs檢出個數(shù)成正比,當(dāng)胚胎數(shù)達(dá)到12以上時SNP檢出率100%。
結(jié)論: 實(shí)現(xiàn)近交系小鼠冷凍胚胎和精子快速SNP基因分型及遺傳質(zhì)量鑒定。