目的:研究常見SPF級小鼠和大鼠的腸道菌群多樣性?
方法:分別采集廣東地區(qū)三家實驗動物生 產(chǎn)單位的C57BL/6?ICR?BALB/c小鼠和Wistar?SD大鼠的盲腸內(nèi)容物樣品,用細菌16SrDNA通用引物擴增V4-V5 區(qū)域,采用IlluminaMiseq2×300bp測序平臺進行測序,使用生物信息學方法進行微生物群落分析?Alpha多樣性 分析與Beta多樣性分析?
結果:對序列去雜優(yōu)化后OTU聚類分析,稀釋性曲線說明本次測序的數(shù)據(jù)量合理;實驗 小鼠和大鼠腸道菌群共分成八個門,其中擬桿菌門(Bacteroidetes)?厚壁菌門(Firmicutes)占據(jù)主要地位,屬水平上 主要是擬桿菌屬(Bacteroides)?Hungatella?副桿狀菌屬(Parabacteroides)?乳酸桿菌屬(Lactobacillus)等;樣品間差異 性分析顯示相同設施來源動物的菌群組成相似性較高;Alpha分析結果顯示來源于同種設施的動物物種豐富度相 近;Beta分析顯示相同設施動物的腸道菌群差異較小,但品系對腸道菌群差異性有所影響?
結論:不同來源設施 的飼養(yǎng)環(huán)境是動物腸道菌群多樣性的主要影響因素,不同品系對腸道菌群多樣性有一定影響?