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【動物實驗外包服務(wù)】-基于高通量測序的不同年齡恒河猴腸道菌群結(jié)構(gòu)差異分析

  目的:觀察不同年齡恒河猴腸道菌群結(jié)構(gòu)和豐度的變化?

  方法:50只恒河猴,分為成年(5 ~ 10 歲)?老年(10歲以上)2組,其中成年組33只,老年組17只? 采集動物的新鮮直腸糞便,提取DNA后使用Illumina 高通量測序平臺對樣本中細(xì)菌16SrDNA-V3區(qū)進(jìn)行測序,定量分析腸道菌群的結(jié)構(gòu)和豐度?

  結(jié)果:老年組和成年 組獲得的優(yōu)化序列數(shù)差異無顯著性(P> 0.05)? α-多樣性分析,老年組恒河猴腸道菌群的 Chao1 指數(shù)(P= 0.0174)?Simpson指數(shù)(P=0.0258)?ACE指數(shù)(P=0.0121)與成年組比較降低,Shannon指數(shù)與成年組比較升高(P =0.0132)? 老年組與成年組相比,在門水平,擬桿菌門(Bacteroidetes)相對豐度升高(P=0.0013),厚壁菌門 (Firmicutes)?螺旋體門(Spirochaetes)?疣微菌門(Verrucomicrobia)?粘膠球形菌門(Lentisphaerae)相對豐度降低(P =0.028 P =0.000 P =0.048 P =0.0242)? 在 科 水 平,Prevotellaceae 相 對 豐 度 升 高(P =0.0001), Ruminococcaceae?Clostridiales?Spirochaetaceae?Christensenellaceae相對豐度降低(P=0.0039,P=0.0080,P=0.000  P=0.0021)? 在屬水平,老年組 unidentified_Prevotellaceae 相對豐度升高(P=0.0001),乳桿菌屬(Lactobacillus)?八 迭球菌(Sarcina)?unidentified_Spirochaetaceae 相對豐度降低(P=0.0114,P=0.0227,P=0.0028)? β-多樣性分析,老 年組腸道菌群與成年組分布在不同區(qū)域,差異有顯著性(P=0.003)? LEfSe 分析,在成年組,鏈球菌屬 (Streptococcus)?布赫納氏菌屬(buchnera)?乳桿菌屬(lactobacillus)是具有統(tǒng)計學(xué)意義的生物標(biāo)記物?

  結(jié)論:恒河猴 腸道菌群的結(jié)構(gòu)隨年齡增長而改變? 豐度降低,多樣性增高?

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