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【動(dòng)物實(shí)驗(yàn)外包服務(wù)】-基于腸道菌群探討雄性WHBE兔與日本大耳白兔膽固醇代謝的差異性

  目的腸道菌群途徑分析雄性日本大耳白兔黑眼系和日本大耳白兔膽固醇代謝的差異性。

  方法 各取4 ~ 5月齡雄性WHBE兔和日本大耳白(JW)兔6只,取血檢測(cè)血脂水平,并取結(jié)腸內(nèi)容物提取DNA后進(jìn)行16S rRNA微生物測(cè)序,觀察腸道菌群結(jié)構(gòu)與功能的變化。

  結(jié)果 雄性 WHBE 兔血清總膽固醇(TC)和低密度脂蛋白-膽固醇水平(LDL-C)均明顯低于JW兔(P< 0. 05)。 多樣性分析顯示,兩品系兔的腸道微生物群分離明顯,WHBE兔Chao1指數(shù)顯著低于JW兔(P<0.05)。 在門水平,WHBE兔梭桿菌門、軟壁菌門和藍(lán)藻菌門的豐度低于JW兔(P< 0. 05,P< 0. 01),且厚壁菌門/擬桿菌門比值亦低于JW兔(P>0. 05)。 在屬水平,WHBE兔中有 24 個(gè)菌屬的相對(duì)豐度與JW兔存在顯著性差異(P< 0. 05,P< 0. 01)。 LEFSe分析顯示,WHBE 兔中發(fā)現(xiàn)了 5 個(gè)關(guān)鍵菌屬,以理研菌科 RC9 群(Rikenellaceae_RC9_gut_group)最多;JW 兔中發(fā)現(xiàn)了10個(gè)關(guān)鍵菌屬,以瘤胃球菌科 UCG-014(Ruminococcaceae_UCG_014)最多。 PICRUSt功能預(yù)測(cè)顯示,兩品系兔腸道菌 群中的花生四烯酸代謝和醚脂代謝途徑存在顯著差異(P< 0. 05,P< 0. 01)。 相關(guān)性分析顯示,TC和LDL-C水平與短波單胞菌屬(Brevundimonas)、回腸桿菌屬( Ileibacterium)、梭桿菌屬(Fusobacterium)、羅爾斯頓菌屬(Ralstonia)、 Mollicutes _ RF39 _ unclassified呈正相關(guān), 與 Coriobacteriaceae _ unclassified、 厭氧菌屬 ( Anaerovorax )、 梭菌屬 (Clostridium)、DTU014_unclassified、Barnesiellaceae_unclassified、瘤胃球菌科 UCG-009(Ruminococcaceae_UCG_009)、 Clostridiales_vadinBB60_group_ unclassified呈負(fù)相關(guān)。

  結(jié)論 雄性WHBE兔和JW兔膽固醇代謝的差異性與宿主的腸道菌群結(jié)構(gòu)與功能差異有關(guān),其中腸道菌群中的花生四烯酸代謝和醚脂代謝途徑尤為關(guān)鍵。

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