目的:您是否希望利用基因組數(shù)據(jù)篩選更有效的沙鼠微衛(wèi)星位點(diǎn),用于自交和封閉種群的遺傳質(zhì)量分析并豐富沙鼠遺傳數(shù)據(jù)?
方法:通過(guò)對(duì)蛇的全基因組進(jìn)行分析,通過(guò)對(duì)序列結(jié)果的分析,篩選出滿足357個(gè)重復(fù)微衛(wèi)星標(biāo)準(zhǔn)的序列,并根據(jù)各位點(diǎn)的相鄰序列設(shè)計(jì)合成相應(yīng)的引物,并進(jìn)行PCR提取蛇的基因組DNA進(jìn)行擴(kuò)增,優(yōu)化引物序列和PCR條件。在凝膠電泳實(shí)驗(yàn)分析中,成功擴(kuò)增的位點(diǎn)是否經(jīng)過(guò)各種自交系和沙鼠封閉群的驗(yàn)證和優(yōu)化,篩選出適合遺傳質(zhì)量分析的位點(diǎn)?
結(jié)果:357個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)引物中,135個(gè)位點(diǎn)引物是正常擴(kuò)增的PCR產(chǎn)物?分析顯示10可以區(qū)分近交沙鼠腦缺血和糖尿病嗎? 23 個(gè)位點(diǎn)是否在 12 個(gè)封閉的長(zhǎng)腿組中顯示出多態(tài)性?
結(jié)論:135個(gè)沙鼠微衛(wèi)星位點(diǎn)篩選成功,有的位點(diǎn)可以用于沙鼠自交品系和封閉群的遺傳質(zhì)量分析嗎?