目的:對西藏小型豬全基因組范圍內(nèi)的組蛋白修飾位點進行注釋,并比較不同組織間組蛋白修飾的差異?

　　方法:取三月齡的雄性非同胎西藏小型豬兩只,分別取其血液?肝?小腸(回腸段)和背最長肌的組織樣 本,進行染色質(zhì)免疫共沉淀實驗,捕獲DNA片段進行高通量測序? 下機數(shù)據(jù)經(jīng)過濾后比對到參考基因組上,并使 用MACS軟件統(tǒng)計reads在基因組上的富集情況?

　　結(jié)果:不同組蛋白在基因啟動子區(qū)域分布的偏好位置不同,分 布規(guī)律大致分為兩類,一類如H3K4me3組蛋白修飾主要分布在轉(zhuǎn)錄起始位點附近的兩側(cè),并在距離TSS較近的下 游位置出現(xiàn)一個寬度較窄的明顯的峰值,另一類如H3K9me3組蛋白修飾在整個啟動子區(qū)域內(nèi)分布較為平均,整體 呈現(xiàn)出中間低兩邊高的寬峰形狀;組織特異性組蛋白修飾影響的基因存在差異,對應(yīng)的功能通路比較廣泛,但都參 與了RNA聚合酶II啟動子的轉(zhuǎn)錄調(diào)控?

　　結(jié)論:本研究提供了西藏小型豬四種組織的組蛋白修飾注釋數(shù)據(jù),為今 后以西藏小型豬為生物醫(yī)學(xué)模型的轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究提供了基礎(chǔ)數(shù)據(jù)?