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基因魔剪 CRISPR/Cas9,如何操縱你的小鼠上天入地


小鼠作為生物醫(yī)學(xué)寶貴的研究工具,廣泛應(yīng)用在模擬腫瘤、代謝疾病、神經(jīng)性疾病等人類疾病的研究過(guò)程中。這是因?yàn)樾∈蠛腿祟惖幕蚪M都包含約 22 400 個(gè)基因。約 99% 的小鼠基因可以在人類基因組中找到同源基因,小鼠模型對(duì)人類疾病治療具有重大借鑒意義。

     加上近些年魔術(shù)剪刀——CRISPR/Cas9 基因編輯技術(shù)的出現(xiàn),讓基因編輯小鼠變成了觸手可得的科研頭牌明星。

     那么這把神奇的剪刀是如何起作用的呢?來(lái)看看在基因編輯小鼠中的應(yīng)用吧。

     第一步  確定修飾的目的基因

     構(gòu)建小鼠前,需要先明確研究涉及的基因。一般分為 2 種情況:

     1. 研究基因功能:顯而易見,在此類研究中涉及的基因是明確的。可以直接利用基因編輯技術(shù)修飾小鼠的基因組,從而通過(guò)小鼠性狀的改變研究其功能。

     2. 研究疾病或是腫瘤:需要先查閱文獻(xiàn),根據(jù)疾病特征選擇目的基因。大部分非傳染性疾病都可以通過(guò)基因修飾在小鼠身上模擬。一般來(lái)講,基因編輯鼠作為研究模型是優(yōu)于藥物誘導(dǎo)或細(xì)胞移植鼠的,因?yàn)榛蚓庉嬍罂梢暂^好地模擬人類疾病發(fā)病的過(guò)程。

     第二步  確定基因編輯的方式

     在明確了構(gòu)建涉及的基因后,我們需要確定編輯該基因的方式?;蚓庉嫃墓δ苌弦话惴譃橐韵聨最悾夯蚯贸↘nockout, KO),條件性基因敲除(Conditional Knockout, CKO),基因敲入(Knock-in, KI)。

     ▌基因敲除(Knockout, KO)小鼠

     基本原理:通過(guò)基因編輯技術(shù)或基因打靶技術(shù)將小鼠體內(nèi)的基因從基因組上刪除,或者造成移碼突變。具體來(lái)說(shuō),是把需要敲除的基因的幾個(gè)重要的外顯子或者功能區(qū)域用 Neo Cassette 替換掉,這樣的小鼠其全身所有的組織和細(xì)胞中都不表達(dá)該基因產(chǎn)物,并能穩(wěn)定遺傳。

     應(yīng)用:研究某個(gè)基因的功能;研究該基因在對(duì)小鼠全身生理病理的影響;構(gòu)建疾病模型等,前提是這個(gè)基因必須沒(méi)有胚胎致死性。

     舉例:ApoE-KO 小鼠

     如 ApoE(載脂蛋白 E)基因是參與脂蛋白的轉(zhuǎn)化與代謝過(guò)程,而敲除該基因會(huì)導(dǎo)致脂蛋白代謝紊亂。ApoE-KO 小鼠會(huì)產(chǎn)生粥樣硬塊,較適合動(dòng)脈粥樣硬化疾病機(jī)理和藥物研發(fā)的研究。

     ▌條件性基因敲除(Conditional Knockout, CKO)小鼠

     研究表明,約 1/3 的小鼠基因?qū)τ谂咛グl(fā)育是必不可少的,即敲除該基因會(huì)使小鼠胚胎死亡,不能生長(zhǎng)發(fā)育。一種 Cre/Loxp 重組的基因編輯系統(tǒng)應(yīng)運(yùn)而生,該系統(tǒng)可以人為控制敲除基因的時(shí)機(jī)或位置,從而在時(shí)間上保證小鼠的發(fā)育,或是在空間上控制基因敲除的范圍。

     基本原理:基于 Cre/Loxp 基因編輯系統(tǒng)。Cre 基因可被具有組織特異性的啟動(dòng)子啟動(dòng),或在合適的時(shí)機(jī)人為誘導(dǎo)表達(dá)。帶有 Loxp 片段的小鼠獲得 Cre 酶后,可以在特定的組織或細(xì)胞中敲除兩端帶有 Loxp 片段的目的基因。

          
                                           條件性基因敲除(CKO)原理示意圖

     應(yīng)用:構(gòu)建在特定組織或細(xì)胞中敲除特定基因的敲除鼠;適用于構(gòu)建具有胚胎致死性的基因敲除鼠;研究基因在特定組織的功能與作用。

     舉例:若需要研究某基因 A 在神經(jīng)系統(tǒng)中的功能,則可以構(gòu)建 loxp-A-loxp 基因敲除鼠,再與 nestin-Cre 鼠交配,由于 nestin 的啟動(dòng)子具有神經(jīng)系統(tǒng)特異性,即可得到神經(jīng)系統(tǒng)條件性敲除 A 基因的鼠。又比如,由于 Kras 基因的敲除導(dǎo)致小鼠胚胎致死,不能正常用于研究。針對(duì)這一情況,構(gòu)建 loxp-Kras-loxp 轉(zhuǎn)基因鼠,在合適的時(shí)機(jī)人為用 Cre 誘導(dǎo)基因在特異組織敲除,這樣就可以方便地研究基因敲除誘發(fā)的癌癥。

     ▌基因敲入(Knock-in, KI)小鼠

     基本原理:通過(guò)基因編輯技術(shù),把外源基因序列敲入到小鼠特定的基因位點(diǎn),利用小鼠的表達(dá)調(diào)控元件指導(dǎo)目的基因表達(dá)。

          
                                                            基因敲入(KI)原理示意圖

     應(yīng)用:一般而言,導(dǎo)入人源基因可以直接研究該基因的功能,或是構(gòu)建人類疾病模型;而導(dǎo)入標(biāo)簽基因則可以觀察某些特定基因的表達(dá),或是觀察細(xì)胞、組織的狀態(tài);導(dǎo)入鼠源基因則可以觀察該基因過(guò)表達(dá)對(duì)小鼠的影響,研究該基因的功能與作用。此類基因敲入鼠一般用于藥物的篩選,信號(hào)通路的研究等。

     舉例:APP-PS1 KI 小鼠

     研究阿茲海默癥這一人類神經(jīng)退行性疾病時(shí),就是通過(guò)在小鼠中引入人源的 APP-PS1 基因,從而在小鼠身上模擬了人類的阿茲海默癥。

     第三步  小鼠品系的選擇

     選擇適合研究目的和方法的基因編輯方式后,也需要選擇合適的小鼠品系?;蚓庉嬍蟮钠废滴覀円话氵x擇 C57BL/6。因?yàn)槠渚哂幸韵绿攸c(diǎn):

     品系穩(wěn)定,常被認(rèn)作「標(biāo)準(zhǔn)」的近交系,為許多突變基因提供遺傳背景;易于繁殖;
     C57BL/6 小鼠是第一個(gè)完成基因組測(cè)序的小鼠品系。

     出于以上的原因,C57BL/6 小鼠被廣泛應(yīng)用于基因編輯模型的建立以及腫瘤學(xué)、生理學(xué)、遺傳學(xué)等方面研究。

     C57BL/6 小鼠

     當(dāng)然另外還有很多小鼠品系也用于基因編輯,如 DBA、BALB/c、BALB/c-Nude 或 129S 等,雖然說(shuō)一般情況下會(huì)選擇 C57BL/6,不過(guò)也要根據(jù)不同小鼠品系的基因表達(dá)及性狀特征來(lái)決定。

     第四步  基因編輯小鼠的構(gòu)建

     根據(jù)上面步驟,我們大概能合適地選擇某種基因敲除或敲入的小鼠模型。現(xiàn)有的小鼠基因編輯技術(shù)包括 ES 基因打靶,ZFNs 和 TALEN 技術(shù)以及近期熱門的 CRISPR/Cas9 基因編輯技術(shù)。就現(xiàn)在最快捷的 CRISPR/Cas9 技術(shù)而言,2 個(gè)月內(nèi)即可獲得 F0 代轉(zhuǎn)基因鼠,4 個(gè)月內(nèi)可獲得 F1 代小鼠。

     構(gòu)建一種基因編輯鼠基本步驟:確定基因、設(shè)計(jì) sgRNA、構(gòu)建 sgRNA、顯微注射、產(chǎn)仔與鑒定、繁殖等一系列步驟。因此,若該基因編輯小鼠是現(xiàn)有的,那便省了許多麻煩,可以通過(guò)購(gòu)買、贈(zèng)送的方式獲得。

     但很多時(shí)候需要構(gòu)建新的基因編輯鼠,如果你自己掌握這項(xiàng)本事固然是好,如果時(shí)間緊迫,此時(shí)尋求第三方機(jī)構(gòu)的幫助或許是個(gè)更好主意,因?yàn)榈谌綑C(jī)構(gòu)專注于構(gòu)建基因編輯鼠,具備更成熟的操作和技術(shù),是節(jié)約時(shí)間和成本的最佳方案。

     目前邦耀實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)成熟掌握利用 CRISPR-Cas9 基因編輯技術(shù),并且成功構(gòu)建了多種基因敲除、敲入及條件性敲除模型,如果您的實(shí)驗(yàn)需要基因編輯鼠或者您有相關(guān)問(wèn)題,歡迎與我們聯(lián)系!
      

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