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免疫共沉淀(co-IP)實(shí)驗(yàn)案例分享

—— co-IP 檢測(cè) Hsp90 與 Cdc37 結(jié)合情況


1、實(shí)驗(yàn)材料


SKBR3 細(xì)胞,PMSF(Amresco,cat:329-98-6),cocktail(上海晶萊生物),脫脂奶粉(cat:66196131T),β-actin(上海晶萊生物)。Anti-Hsp90(santa,cat:sc-69703)、Anti-Cdc37(santa,cat:sc-13129)、Protein A+G agrose(Beyotime),細(xì)胞刮,4 度離心機(jī)(eppendorf,centrifuge 5415R),搖床(ORBITAL SHAKER,TS-1000),電泳儀(Tanon EPS300)。低速離心機(jī)(cat:TDZ4B-WS)。


2、實(shí)驗(yàn)方法


制樣:


細(xì)胞裂解液配制:


基礎(chǔ)裂解液中加入 PMSF,cocktail 和 DTT


  • 實(shí)驗(yàn)分組


  • Control 組 、化合物 11(10μM)、化合物 11(20μM)、化合物 11(40μM),給藥時(shí)間 24 h。


  • 棄培養(yǎng)上清,PBS 洗一遍,冰上加入 150ul/孔裂解液。


  • 于冰上裂解 30 min,為使細(xì)胞充分裂解培養(yǎng)瓶要經(jīng)常來(lái)回?fù)u動(dòng)。


  • 裂解完后,于 4℃ 下 12000rpm 離心 15 min。


  • 收集蛋白上清,取少許裂解液用于后續(xù)檢測(cè)各蛋白表達(dá)情況。


  • 剩余的裂解液加入 Anti-Cdc37,4℃ 緩慢搖晃孵育過(guò)夜。


  • 用適量裂解緩沖液預(yù)處理 ProteinA+G,20uL/管加入各抗體孵育過(guò)夜的細(xì)胞裂解液中,4℃ 緩慢搖晃孵育 2~4 h。


  • 免疫沉淀反應(yīng)后,4℃,3000rpm,3 min,小心吸取上清,瓊脂糖珠用 1 mL 裂解液沖洗 3-4 次,最后加入 15uL 2*SDS 上樣緩沖液,100℃,5 min。


  • Laemmli-SDS-PAGE


電泳:


電泳時(shí)根據(jù)情況每塊膠 15mA 恒流電源;根據(jù)預(yù)染 Marker 和目的蛋白的分子量大小的相對(duì)位置判斷最佳跑膠時(shí)間,以使目的蛋白處于分離膠面的下 1/3 的最佳分辯位置。


轉(zhuǎn)膜:


  • 將 PVDF 膜放到甲醇中浸泡 2 min


  • 將轉(zhuǎn)膜夾打開,在代表負(fù)極的黑色面鋪上一塊濕潤(rùn)的海綿墊,再添加 2 層濕潤(rùn)的濾紙,將 SDS-PAGE 膠小心地鋪在濾紙上,表面再覆蓋大小合適的 PVDF 膜;然后再覆蓋兩層濕潤(rùn)濾紙,再墊上濕潤(rùn)的海綿墊,將紅色的正極板合上,夾好,插入轉(zhuǎn)膜槽相應(yīng)的位置。


  • 轉(zhuǎn)膜過(guò)程在 4℃ 進(jìn)行,采用 100V/100mA。


  • 麗春紅染色:轉(zhuǎn)膜過(guò)程完成后,將膜從轉(zhuǎn)膜夾中取出,立即投入麗春紅染液中染色,大約染色 5 分鐘后將膜由麗春紅中取出,用清水輕輕沖洗膜,注意觀察膜上的紅色條帶,當(dāng)條帶足夠清晰后停止水洗,根據(jù)染色條帶把膜適當(dāng)剪小,留出目的蛋白所在的范圍。然后用清水徹底沖洗膜,盡可能洗去殘留的麗春紅,使得條帶消失。


封閉:


一般抗體采用 5% 脫脂奶粉+TBST 封閉;封閉時(shí)間為室溫下一個(gè)小時(shí),在搖床上進(jìn)行。


一抗雜交:


在一個(gè) 1.5 ml 的 EP 管中加入 1 ml 的封閉液(5% 脫脂奶粉+TBST),再加入適量的一抗,置于 4℃ 冰箱中過(guò)夜。


洗膜:


將過(guò)夜雜交的膜從塑料袋中取出,投入含有足量體積 TBST 的洗膜盒中,于搖床上清洗,每次 10 分鐘,連續(xù) 3 次。


二抗雜交:


處理步驟類似一抗雜交步驟,不同之處在于二抗雜交可在常溫下,1 小時(shí)內(nèi)完成。二抗比例控制在 1:2000~1:5000。


洗膜:


見(jiàn)步驟 7。


顯影:


將膜平放于干燥的平面上,將新鮮配置好的 ECL Reagent 滴加到有鉛筆記號(hào)標(biāo)注的膜面上,反應(yīng) 5 分鐘后用濾紙?jiān)谀さ倪吘壉M量吸去多余的 ECL Reagent,將膜放到化學(xué)發(fā)光儀中收集信號(hào)。


三、實(shí)驗(yàn)結(jié)果:

IP:Hsp90,IB:Cdc37

IP:Hsp90,IB:Cdc37--黑白

IP:Hsp90,IB:Hsp90

IP:Hsp90,IB:Hsp90--黑白


(本文轉(zhuǎn)載丁香通)

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